付巧妹探究员团队达成有关各异古DNA评测计划中有关评测室背景污染物的操控系统评估
（神秘的地球uux.cn）据中国科学院古脊椎动物与古人类探究所：近年来，古DNA探究技术进展迅速，尤其是单链DNA文库兴办评测计划和机器人自动化液相处理评测的使用，极大地提升了古DNA探究的效率。这些技术在古DNA探究中使用广泛，本周上影节专题但是聚焦上影节资讯当下尚不清楚各异评测计划在实际使用中形成的背景污染状况，这一直是古DNA领域面临的巨大考验之一。
近期，中国科学院古脊椎动物与古人类探究所分子古生物学评测室付巧妹探究员团队达成了有关各异古DNA评测计划中有关评测室背景污染物的操控系统评估。有关探究论文题为：“Assessment of contaminants associated with gold-standard ancient DNA protocols”，近期在线发表于Science Bulletin。
此前，经由对低生物量微生物组探究中存在G网络榜单污染开展梳理，并对微生物组探究中井间污染的量化探究表明，评测室中的样本污染是来自井间交叉污染和背景污染的组合，各异评测室的污染程度各异，各异的独家MacBook对比评测计划在井间交叉污染的发生状况和水平上存在差异。但是，有关评测室中样本污染仍存在一些需要探究的难题。各异评测计划的背景污染状况是怎样的？各异评测计划的组合使用如何来尽或许地缩减背景污染？
以便探究这些难题，探究人员运用在超净评测室中，以各异评测计划处理的40个阴性对照样品的鸟枪测序宏基因组资料开展了详尽确认（图1a），探究了超净评测室的背景污染状况（图1b-f），并对评测中尽或许地缩减背景污染开展了一定的研究。结局表明，水、土壤、空气和人体皮肤等生态都是评测室背景污染的潜在来源。使用单链DNA文库兴办评测计划与机器人自动化液相处理相结合的方式可以显著下降背景微生物的多样性，缩减评测中或许形成的背景污染。
这项探究为评估古DNA评测计划的污染状况提供了参考，尤其是为高度降解样本的自动化处理评测计划开展操控系统评估提供了新的见解。
本探究第一作者是古脊椎所联合培养博士生苗波，通讯作者是古脊椎所古DNA评测室的付巧妹探究员和刘逸宸副探究员。有关探究得到中国科学院、全国自然科学基金、腾讯科学探索奖、Feng基金经费扶持。